گروه میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی همدان ، yousefimash@yahoo.com
چکیده: (6708 مشاهده)
سابقه و هدف:کندی و خطای انسانی در روش های معمول جهت تشخیص دوگونه انتروکوک فکالیس و انتروکوک فاسیوم که جزء مهمترین گونه های بیماریزا در انسان
می باشند، وجود روشهای دقیقتر را ضروری کرده است. هدف از این مطالعه طراحی روشی دقیق و سریع با استفاده از تکنیک ذوب DNA با روش Real Time PCR جهت شناسایی و تفکیک این دو گونه از یکدیگر در ایزوله های بالینی می باشد.
مواد و روش‌ها: در این مطالعه تجربی از ایزوله های موجود در بانک باکتریایی گروه میکروب شناسی دانشگاه علوم پزشکی همدان استفاده شد. طراحی پرایمرها با استفاده از نرم افزارهای اختصاصی و انتخاب ژن های divIVA برای تشخیص انتروکوکفکالیس وAlanine racemase برای تشخیص انتروکوک فاسیوم انجام شد. تشخیص ایزوله ها، با بکارگیری روش Real Time PCR و معیار قراردادن دمای ذوب DNA، مورد ارزیابی قرار گرفت.
یافته ها:حساسیت پرایمرهای طراحی شده برای ژنهای divIVA (اختصاصی انتروکوکفکالیس) و Alanine racemase (اختصاصی انتروکوکفاسیوم) CFU/ml 15 باکتری بودند. اختصاصیت پرایمرهای طراحی شده با استفاده از آنالیز منحنی ذوب دمایی جهت شناسایی انتروکوکفکالیس 76/6 درجه سانتی گراد و جهت شناسایی انتروکوکفاسیوم 80/93 درجه سانتی گراد بود که در مقایسه با ارگانیسم های دیگر اختلاف قابل توجهی را نشان داد.
نتیجه‌گیری: بر اساس این مطالعه، پرایمرهای طراحی شده دارای حساسیت و اختصاصیت مناسبی جهت تشخیص و افتراق گونه های انتروکوک فاسیوم و انتروکوک فکالیس بودند
Zeyni B, Arabestani M, YousefiMashof R, Tahmasebi H. Evaluation of Real-time PCR-based DNA melting method for detection of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium in clinical isolates
. J Babol Univ Med Sci 2017; 19 (2) :26-33 URL: http://jbums.org/article-1-6226-fa.html
زینی بهروز، عربستانی محمدرضا، یوسفی مشعوف رسول، طهماسبی حامد. ارزیابی روش ذوب
DNA
مبتنی بر
Real-time PCR
جهت تشخیص انتروکوک فکالیس و انتروکوک فاسیوم در ایزوله های بالینی . مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی بابل. 1395; 19 (2) :26-33
