fa مقایسه هویت‎ ‎مولکولی‎ ‎مایکو‎ ‎پلاسماهومینیس ادرار‎ ‎بیماران‎ ‎مبتلا‎ ‎به عفونتهای با سایر جدایه‌های مشابه موجود در بانک ژن میکروبیولوژی Microbiology توصیفی Dicscriptive <p dir="rtl" style="line-height: 13.05pt direction: rtl unicode-bidi: embed"><strong><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: blue">سابقه و هدف:</span></strong><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: blue"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">مایکوپلاسماها از عوامل مهم عفونتهای ادراری هستند. پژوهشهای زیادی بر پایه روش­های کشت و بیوشیمیائی جهت جداسازی این باکتری از دستگاه ادراری تناسلی انجام شده اما مطالعه مولکولی و فیلوژنتیک آنها اساس بررسی­های اپیدمیولوژیک خواهد بود. هدف از این تحقیق جداسازی و تعیین هویت مولکولی مایکوپلاسماهومینیس جداشده از ادرار بیماران مبتلا به عفونتهای ادراری شهر کرمان و مقایسه توالی آنها با سایر جدایه­های موجود در بانک ژن می باشد.</span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt font-family: Tahoma, sans-serif color: rgb(51, 51, 51)"><!--stripped--><!--stripped--></span></p> <p dir="rtl" style="line-height: 13.05pt direction: rtl unicode-bidi: embed text-align: start"><strong><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: blue">مواد و روشها:</span></strong><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: blue"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">در این مطالعه مقطعی 5 میلی لیتر ادرار میانی 50 بیمار مبتلا به عفونت ادراری پس از تأیید پزشک متخصص توسط آزمایشات پاراکلینیکی با استفاده از پرایمرهای اختصاصی قطعه­ای از ژن</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">16S rRNA</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">مایکوپلاسما هومینیس به روش</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">PCR</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">تکثیر و پس از خالص سازی محصول</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">PCR</span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">، جدایه­های باکتری تعیین توالی شدند و سپس با استفاده از نرم­افزار</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">Bio Edit</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">هم ردیف­کردن توالیها و مقایسه جدایه­ها با یکدیگر و با سایر جدایه­های موجود در بانک ژن انجام شد.</span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)"><!--stripped--><!--stripped--></span></p> <p dir="rtl" style="line-height: 13.05pt direction: rtl unicode-bidi: embed text-align: start"><strong><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: blue">یافته­ ها:</span></strong><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: blue"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">3 جدایه مایکوپلاسما هومینیس جدا گردید. همردیف کردن توالی ها و مقایسه آنها با توالی­های موجود در بانک ژن تفاوت معنی داری نداشت. مطالعات فیلوژنتیک انجام گرفته در این پژوهش و درخت فیلوژنتیک ترسیم شده نشان می­دهد که یکی از جدایه­های این پژوهش (جدایه</span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">H6<span class="apple-converted-space"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">) با سایر جدایه های ثبت شده در بانک ژن قرابت بالایی دارد و در یک دودمان قرار می­گیرد. در حالیکه دو جدایه دیگر (11</span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">H</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">و 15</span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">H</span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">) در یک دودمان جداگانه و کاملا مجزا از جدایه دیگر و سایر جدایه­های ثبت شده در بانک ژن قرار گرفته و با تمام آنها قرابت ندارد.</span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)"><!--stripped--><!--stripped--></span></p> <p dir="rtl" style="line-height: 13.05pt direction: rtl unicode-bidi: embed text-align: start"><strong><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: blue">نتیجه گیری:</span></strong><span class="apple-converted-space"><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: blue"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">مایکوپلاسماها از مهمترین عوامل عفونت ادراری هستند. در این مطالعه پس از انجام</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">PCR</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">و جداسازی باکتری، با مقایسه توالی­ها در بانک ژن تأیید گردید که هر سه جدایه بر اساس توالی ژن</span><span class="apple-converted-space"><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)"> </span></span><span dir="ltr" style="font-size: 10pt color: rgb(51, 51, 51)">16S rRNA</span><span lang="AR-SA" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: rgb(51, 51, 51)">، مایکوپلاسما هومینیس هستند.</span><span style="font-size: 10pt"> </span></p> <p class="MsoNormalCxSpFirst" style="line-height: 16pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><font face="times new roman, times, serif"><b><span style="font-size: 10pt color: blue">BACKGROUND AND OBJECTIVE:</span></b><span style="font-size: 10pt"> </span><span style="font-size: 10pt">Mycoplasmal infections are one of the most important urinary infections. Various studies have applied culture studies and biochemistry to separate the bacteria from the urinary tract. However, it should be noted that molecular and phylogenetic analyses are based on epidemiologic evaluations. The purpose of this study was to determine the molecular identity of Mycoplasma hominis, separated from the urine samples of patients with urinary tract infections in Kerman, Iran and compare the sequences with other strains in GenBank</span><span style="font-size: 10pt">.<!--stripped--><!--stripped--></span></font></p> <p class="MsoNormalCxSpMiddle" style="line-height: 16pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><font face="times new roman, times, serif"><b><span style="font-size: 10pt color: blue">METHODS:</span></b><span style="font-size: 10pt"> </span><span style="font-size: 10pt">In this cross-sectional study, 5 ml mid-stream urine samples of 50 patients with urinary tract infections were collected. </span><span style="font-size: 10pt">After the specialists confirmed the diagnosis of urinary tract infections in patients via paraclinical tests</span><span style="font-size: 10pt">, segments of 16S rRNA gene were amplified, using specific primers of</span><span style="font-size: 10pt"> Mycoplasma hominis via polymerase chain reaction (PCR) technique</span><span style="font-size: 10pt">. After purifying the PCR product, the sequences of bacterial strains were determined. Then, the sequences were aligned and the strains were compared with each other and other strains available in GenBank, using BioEdit software</span><span style="font-size: 10pt">.<!--stripped--><!--stripped--></span></font></p> <p class="MsoNormalCxSpMiddle" style="line-height: 16pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><font face="times new roman, times, serif"><b><span style="font-size: 10pt color: blue">FINDINGS:</span></b><span style="font-size: 10pt text-transform: uppercase"> </span><span style="font-size: 10pt">Three </span><span style="font-size: 10pt">Mycoplasma hominis strains were separated in this study. The alignment of sequences and comparison with strains available in GenBank did not indicate a significant difference between the strains. Based on phylogenetic analyses in this study and the phylogenetic tree, one of the strains (H6) was highly similar to the strains of GenBank and belonged to the same family. On the other hand, two strains (H11 and H15) were of a different lineage and were completely different from other strains in the present study and those recorded in GenBank. </span><span style="font-size: 10pt"><!--stripped--><!--stripped--></span></font></p> <p><font face="times new roman, times, serif"><b><span style="font-size: 10pt color: blue">CONCLUSION: </span></b><span style="font-size: 10pt">In this study, after applying the PCR technique and bacterial separation, the sequences were compared with those in GenBank. All three strains were </span><span style="font-size: 10pt">Mycoplasma hominis,</span><span style="font-size: 10pt"> based on 16S rRNA gene sequence.</span></font></p> مایکوپلاسما هومینیس, عفونت ادراری, واکنش زنجیره‌ای چندگانه, توالی نوکلئوتیدی, ژن ‏‎16S rRNA‎ Mycoplasma hominis, Urinary tract infection, Polymerase chain reaction, Nucleotide sequence, 16S rRNA gene‎ 53 59 http://jbums.org/browse.php?a_code=A-10-1449-1&slc_lang=fa&sid=1 H Eftekhari حکیمه افتخاری 100319475328460013039 100319475328460013039 No B kheirkhah بابک خیرخواه b.kheirkhah@srbiau.ac.ir 100319475328460013040 100319475328460013040 Yes B Amirheydari باقر امیر حیدری 100319475328460013041 100319475328460013041 No