fa ارتباط بین گروه های فیلوژنتیکی با ژن های کد کننده فاکتور های حدت در ایزوله های اشریشیاکلای خارج روده ای به روش Multiplex-PCR فیزیولوژی Physiology تجربی Experimental <p class="MsoNormal" dir="rtl" style="line-height: 16pt"><b><span lang="FA" style="font-size: 12pt font-family: '2 Mitra' color: blue">خلاصه<o:p /></span></b></p> <p class="MsoNormal" dir="rtl" style="line-height: 16pt"><b><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra' color: blue">سابقه و هدف:</span></b><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"> باکتری اشریشیاکلای خارج روده ای مهمترین عامل عفونت های ادراری-تناسلی در انسان است. چندین فاکتور حدت مثل ژن های کد کننده پروتئین های سیتوتوکسین، ادهسین، رسپتورهای سیدروفور و پروتئاز خارج غشائی در <i>اشریشیاکلای</i> های خارج روده ای انسان شناسایی شده است. این مطالعه به منظور بررسی میزان توزیع ژن های کد کننده فاکتور های حدت و ارتباط آن با گروه های فیلوژنتیکی در ایزوله های <i>اشریشیاکلای</i> جدا شده از بیماران مراجعه کننده به کلینیک های زنان شهرستان زابل انجام شد.<o:p /></span></p> <p class="MsoNormal" dir="rtl" style="line-height: 16pt"><b><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra' color: blue">مواد و روشها</span></b><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'">: در این مطالعه مقطعی تعداد 132 باکتری <i>اشریشیاکلای</i> با استفاده از روش های بیوشیمیایی استاندارد جداسازی شد. </span><span dir="ltr"></span><span dir="ltr"><span dir="ltr"></span> DNA</span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'">ژنومی تمام ایزوله ها به روش جوشاندن استخراج گردید. حضور ژن های کد کننده فاکتور های حدت سیتوتوکسین (</span><i><span dir="ltr">cnf1</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>)، ادهسین غیرهموآگلوتنین (</span><i><span dir="ltr">iah</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>)، همولوگ سیدروفور (</span><i><span dir="ltr">irp2</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>) و پروتئاز خارج سلولی (</span><i><span dir="ltr">ompT</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>) به روش </span><span dir="ltr">Multiplex-PCR</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> مورد بررسی قرار گرفت. گروه بندی فیلوژنتیکی تمام ایزوله ها با استفاده از حضور یا عدم حضور ژن های </span><i><span dir="ltr">chuA</span></i><span dir="rtl"></span><i><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>، </span></i><i><span dir="ltr">yjaA</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> و قطعه</span><span dir="ltr">TspE4.C2</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> به روش </span><span dir="ltr">Triple-PCR</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> انجام شد.<o:p /></span></p> <p class="MsoNormal" dir="rtl" style="line-height: 16pt"><b><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra' color: blue">یافته‌ها:</span></b><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"> میزان شیوع ژن های های </span><i><span dir="ltr">cnf1</span></i><span dir="rtl"></span><i><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>، </span></i><i><span dir="ltr">iha</span></i><span dir="rtl"></span><i><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>، </span></i><i><span dir="ltr">irp2</span></i><span dir="rtl"></span><i><span style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> </span></i><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'">و</span><i><span dir="ltr">ompT</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> در بین 132 ایزوله به ترتیب 10%، 8%، 45% و 63% تعیین گردید. از مجموع 132 ایزوله <i>اشریشیاکلای</i> 14، 7، 60 و 19 درصد به ترتیب در گروه های فیلوژنتیکی </span><span dir="ltr">A</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>، </span><span dir="ltr">B1</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>، </span><span dir="ltr">B2</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> و </span><span dir="ltr">D</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> قرار گرفتند. بیشترین میزان توزیع ژن های کد کننده فاکتور های حدت در گروه </span><span dir="ltr">B2</span><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> با فراوانی </span><i><span dir="ltr">cnf1</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>(100%)، </span><i><span dir="ltr">iha</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>(5/62%)، </span><i><span dir="ltr">irp2</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>(01/73%) و</span><i><span dir="ltr">ompT</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" style="font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span>(44/84%) نسبت به سایر گروه ها تعیین گردید. <o:p /></span></p> <b><span lang="FA" dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra' color: blue">نتیجه گیری:</span></b><span lang="FA" dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra'"> نتایج این مطالعه نشان داد که </span><i><span style="font-size: 10pt font-family: 'Times New Roman', serif">ompT</span></i><span dir="rtl"></span><span lang="FA" dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> و</span><i><span style="font-size: 10pt font-family: 'Times New Roman', serif">irp2 </span></i><span dir="rtl"></span><span dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra'"><span dir="rtl"></span> <span lang="FA">شایعترین ژن های کد کننده فاکتور های حدت درایزوله های</span></span><span dir="ltr"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Times New Roman', serif"><span dir="ltr"></span> </span><span lang="FA" dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra'">اشریشیاکلای خارج روده ای جدا شده از عفونت دستگاه تناسلی می باشد. این</span><span dir="ltr"></span><span lang="FA" style="font-size: 10pt font-family: 'Times New Roman', serif"><span dir="ltr"></span> </span><span lang="FA" dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra'">مسئله می تواند اطلاعاتی در رابطه با اهمیت آنها در آسیب شناسی عفونت دستگاه تناسلی که منجر به دست یابی به درمان های موثرتر می شود در اختیار محققین قرار دهد</span><span lang="FA" dir="rtl" style="font-size: 10pt font-family: '2 Mitra'">. </span> <p class="MsoNormal" style="line-height: 16pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><b><span style="color: blue">ABSTRACT<o:p /></span></b></p> <p class="MsoNormal" style="line-height: 15pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><b><span style="color: blue">BACKGROUND AND OBJECTIVE:</span></b> Extraintestinal Escherichia coli bacteria is the main reason behind the urogenital infections in humans. Several virulence factors such as cytotoxin genes coding for proteins, adhesion, siderophore receptors and outer-membrane protease are detected within the extraintestinal  Escherichia coli.  This study aimed to investigate the distribution of genes encoding virulence factors and their correlation with phylogenetic groups in Escherichia coli isolates. The samples were taken from the patients referring to the women’s clinics in the city of Zabol, Iran.<o:p /></p> <p class="MsoNormal" style="line-height: 15pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><b><span style="color: blue">METHODS:</span></b> In this study, 132 Escherichia coli bacteria were isolated through standard, biochemical methods while all isolated genomic DNA was extracted by boiling. The presence of Cytotoxin Necrotizing Factor 1 (CNF1), IrgA homologue adhesin (iha), iron-responsible protein (irp2) and  outer-membrane protease (ompT) was studied via Multiplex-PCR method. Furthermore, utilizing Triple-PCR method, we were able to carry out phylogenetic grouping of all the isolates using the presence or absence of such genes as chuA, yjaA and TspE4.C2 piece.<o:p /></p> <p class="MsoNormal" style="line-height: 15pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><b><span style="color: blue">FINDINGS:</span></b> Among 132 isolates, the prevalence of the following genes were determined as CNF1 (10%), iha (8%), irp2 (45%) and ompT (63%). Moreover, for the total number of 132 Escherichia coli isolates, 14%, 7%, 60% and 19% were placed in phylogenetic groups A, B1, B2 and D respectively. Most of the distribution of the genes encoding virulence  factors were observed in the B2 group, with an abundance of CNF1 (100%), iha (5.62%), irp2 (01/73%) and ompT (44/84%) in comparison with the other groups.<o:p /></p> <p class="MsoNormal" style="line-height: 15pt direction: ltr unicode-bidi: embed"><b><span style="color: blue">CONCLUSION:</span></b> This study concluded that ompT and irp2 are the most frequent genes to isolate virulence factors of extraintestinal Escherichia coli from the genital tract infections. This finding could provide researchers with information regarding the importance of the pathology of reproductive tract infections and thus, help them with discovering more effective remedies.<o:p /></p> عفونت دستگاه تناسلی, پروتئاز خارجی غشاء, سیتوتوکسین, ادهسین, آنالیز فیلوژنتیکی, اشریشیاکلای. Genital Tract Infections, Outer-Membrane Protease, Cytotoxin Adhesion, Phylogenetic Analysis, Escherichia coli. 36 42 http://jbums.org/browse.php?a_code=A-10-1364-3&slc_lang=fa&sid=1 Ahmad Rashki احمد راشکی 10031947532846008813 10031947532846008813 Yes Hosseiali Abdi حسینعلی عبدی 10031947532846008814 10031947532846008814 No