پژوهشکده بیوتکنولوژی، دانشگاه شهرکرد ، emadi-m@sci.sku.ac.ir
چکیده: (5674 مشاهده)
سابقه و هدف:بیماری فنیلکتونوری شایعترین خطای مادرزادی متابولیسم آمینواسید در جهان است و نرخ بروز آن در ایران در حال افزایش است. هدف از مطالعه حاضر، بررسی کارایی روش HRMبه عنوان روشی سریع و مناسب در شناسایی جهشهای شایع ژن فنیلآلانین هیدروکسیلاز منجمله IVS10-11G>A و P281L میباشد، تا با کمک به تشخیص زود هنگام این بیماری بتوان از بروز علائم آن جلوگیری کرد.
مواد و روشها:در این مطالعه مورد-شاهدی 20 نمونه DNA شامل یک نمونه حاوی جهش IVS10-11G>A و یک نمونه حاوی جهش P281L و 18 نمونه کنترل فاقد بیماری PKU که از خون محیطی استخراج شده و از مرکز ژنتیک پزشکی اصفهان جمعآوری شدند با روش HRM در دستگاه Real time PCR تعیین ژنوتیپ گردیدند. جهت تایید جهش ها، نمونههای جهش یافته با روش توالییابی تعیین ژنوتیپ شدند. مطالعه بیوانفورماتیکی برای تعیین اثرات ساختاری و عملکردی جهش P281L بر پروتئین PAH استفاده شد.
یافته ها:روش HRM جهشهای IVS10-11G>A و P281L را با اختصاصیت و حساسیت 100% شناسایی کرد و نمونههای جهش یافته و کنترل در نمودارهای طبیعیسازی و تمایز به راحتی از هم قابل تفکیک و تمایز بودند. مطالعات بیوانفورماتیکی اثرات ناپایداری و بیماریزا بودن پروتئین PAH حاوی جهش P281L را نشان دادند.
نتیجه گیری: نتایج مطالعه نشان داد که روش HRM روشی ساده و سریع است و با اختصاصیت و حساسیت 100% توانست دو جهش IVS10-11G>A و P281L را شناسایی کند.
Amir M, Emadi-Baygi M, Vallian S, Nikpour P, Akhondi F. Molecular assessment and bioinformatic analysis of two common mutations of phenylalanine hydroxylase (PAH) gene by HRM. J Babol Univ Med Sci 2017; 19 (6) :42-49 URL: http://jbums.org/article-1-6549-fa.html
امیر ملیکا، عمادی بایگی مجتبی، ولیان صادق، نیک پور پروانه، آخوندی فاطمه. بررسی مولکولی و آنالیز بیوانفورماتیکی دو جهش شایع ژن فنیلآلانین هیدروکسیلاز(PAH) با روش HRM. مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی بابل. 1396; 19 (6) :42-49
